Los indicadores están estructurados a partir de siete (7) categorías (Educación, TIC, Salud, Población, Participación, Economía y Violencia), que a su vez se dividen en subcategorías de análisis de acuerdo a la temática abordada para mostrar la posición, en términos cuantitativos, en la que se encuentran tanto los hombres como las mujeres frente a un fenómeno y en un período o momento determinado.

El SISGE atiende al compromiso de la ONE de visibilizar la situación diferenciada entre hombres y mujeres a través de la difusión de estadísticas género sensitivas, como una respuesta a las demandas provenientes de los distintos instrumentos internacionales de los cuales el país es signatario y de las principales herramientas de planificación nacional.